6月1日，学会启动第三届“广东十大科学传播达人”推荐评选活动。

6月4日，学会举办病毒性肝炎诊疗新进展系列沙龙活动(第二季)疑难肝病会诊学术沙龙。

6月5日，医工结合分会在学会召开第一次线上筹备会。

6月6日，珠海通桥医疗科技有限公司的《缺血性脑卒中螺旋开放式取栓支架》成为学会首个鉴定通过的精准医学科技成果。

6月7日，广东省科协系统召开传达学习中国科协第十次全国代表大会精神会议，学会秘书长孙炳刚作为全省十大代表的唯一代表做会议交流发言。

6月7日，广东省科协公示2021年寻找广东“最美科技工作者”遴选结果，学会推荐的法医学分会牵头发起人、南方医科大学法医学院院长朱波峰教授获入选。

6月7日，由南方医科大学南方医院提出和主编、多家单位共同参与编写的团体标准《应用于医院VTE防治的临床决策支持系统(CDSS)建设规范》经学会批准正式发布。

6月7日，学会举办病毒性肝炎诊疗新进展系列沙龙活动(第二季)肝癌多学科诊治学术沙龙。

6月9日，儿童生长发育分会经学会常务理事会批准成立。

6月11日，学会发出倡议号召学会党员会员在当前疫情防控中发挥先锋模范作用。

6月13日，中国科协公布2021年海峡两岸暨港澳科技交流合作重点项目拟资助13个申报项目，学会配合省科协申报的《2021海峡两岸暨港澳精准医学青年博士论坛》项目成功入选。

6月15日，学会向近期日夜奋战在抗疫一线的广东医护人员、抗疫工作者致以端午节慰问。

6月15日-28日，学会党支部开展庆祝建党100周年系列活动，线上VR打卡广东上百个红色地标，重温百年党史。

6月16日，学会举办2021年帕金森专科青年医师线上巡讲系列活动异动症专场。

6月16日，学会线上举办顺德地区药学抗感染沙龙第二期。

6月18日，学会线上举办病毒性肝炎诊疗新进展系列沙龙活动(第三期)“丙肝筛查转诊实践学术沙龙”。

6月20日，儿童生长发育分会召开筹备会。

6月21日，学会举办免疫性疾病治疗新进展系列研讨会之皮肤病线上专场会议。

6月22日，学会联合中华结直肠癌MDT联盟举办匠心镜语线上系列培训第十三期活动“低位直肠癌保肛治疗”。

6月23日，学会线上举办病毒性肝炎诊疗新进展系列沙龙活动(四期)“慢乙肝骨肾风险优化治疗管理”。

6月23日，学会举办免疫性疾病治疗新进展系列研讨会之皮肤科线上专场会议。

6月25日，省科协党组成员、专职副主席范英妍召集学会、省科协合作交流部商讨《2021海峡两岸暨港澳精准医学青年博士论坛》项目执行工作。

6月25日，学会推荐的南方医科大学法医学院院长朱波峰教授成功当选2021年广东“最美科技工作者”，学会获评优秀组织单位。

6月25日，尹爱华主任召集召开《染色体嵌合体的产前遗传学诊断与遗传咨询》团体标准第三次专家研讨会。

6月29日，学会党支部开展庆祝建党100周年系列活动，走进红色教育基地—广州起义纪念馆，缅怀革命先烈，重温入党誓词。